果型区别

香水柠檬较普通柠檬果型修长，冬瓜形状，两头没这么尖。而且叶子也有有细微差别，香水柠檬会更细长一点，但不太好辨别。

花型区别

香水柠檬的花是外面全紫色，均匀的淡紫色，花苞是长条状，头上是尖的。普通柠檬像尤利克的花苞都是反向南瓜状。

香味区别

既然叫香水柠檬，其柠檬幼芽、叶子味道要比普通柠檬味道大，一闻便知。

口感区别

香水柠檬完全没有一般柠檬的那种酸涩的味道，用来制作蜂蜜柠檬茶的也口味也更为清甜。

营养不同

香水柠檬中含有的果糖和维生素c的含量要远远高于普通柠檬。