两者主要有支付方式、理财产品、扩展功能方面的区别：

支付方式不同。理财通可以用银行卡里面的钱来购买各种理财产品，但是不能用微信零钱来购买；而微信零钱通则既可以用微信零钱支付，也可以用银行卡支付。

理财产品不同。微信零钱通当前只能购买几款货币基金；而理财通则可以购买活期理财余额+、定期理财产品、保险产品、券商产品以及基金等。

扩展功能不同。微信理财通里面的钱不能用作其他用途，包括其中的余额+活期理财产品。而零钱通里面的钱支持用来发红包、转账给别人、消费等各种功能。