梳理发现，和田玉上有黑点主要有两种原因，一是内部铁、铬离子聚集。因为和田玉中的组成成分有透闪石、阳起石，这些矿物中又含有三价铬离子和二价铁离子，当这些成分剧集在一起后会发生反应。

二是和田玉在自然中受到风吹雨打，会形成一些缝隙杂质。为了美观制作者会在加工过程中对其进行上蜡处理，随着佩戴时间增加，和田玉层表面的蜡层会自然脱落、消失，所以玉的表层会形成黑色小点。