可以。如果是要冷冻菠萝蜜果肉的话建议不要去核保存，因为菠萝蜜去核之后果肉分散，不易保存，而且更容易流失水分和营养成分，降低营养价值，冷冻过后的口感会更加差。

如果是想把菠萝蜜核剥下来全部冷冻的话也是可以的，建议将其先煮熟后再进行冷冻，这样后面吃起来会更方便一些，而且也可以起到保鲜的作用，但也需要注意不能冻太长的时间。

或者将菠萝蜜核拿到太阳下面稍微晒一晒，把菠萝蜜核晒干也是可以长期保存的。