房贷余额不足的情况下，银行不会自动补扣。需要自行将用于偿还房贷的资金存入银行卡后，通知银行方面进行再次扣款。通常情况，银行在扣款之后发现余额不足的情况就会通知用户补交，但是这种情况已经属于违约行为，因此还会需要缴纳一定的滞纳金。需要提醒的是，房贷一定要存足，若是多次出现余额不足的情况，就会被银行记录为黑名单。