办理商业贷款转公积金贷款是必须要先把商业贷款还清的。其主要原因在于商业贷款转公积金贷款的主要条件就是要取得所购房屋的产权证，毕竟这个产权证是在转公积金贷款之后抵押给住房公积金中心的。若是商贷没有还清，原件还是在银行的。