不会，单纯的申请公积金贷款并不会导致公积金账户里面的钱变少，只是说申请贷款成功之后，若是办理了对冲还款，那么每个月还款的时候会优先扣除公积金账户里面的钱。办理了月冲还贷业务且公积金账户余额充足，会优先从公积金账户扣划，如果借款人和共同借款人公积金账户余额不足，则会从还款卡里扣划。