公积金对冲扣款的时候并不能夫妻一起扣款。夫妻共同申请公积金贷款的情况下，一方为主贷人，另一方为次贷人。通常情况在对冲扣款的时候，会优先扣除主贷人的公积金账户余额，主贷人公积金账户余额不足的情况下才会扣除次贷人公积金账户余额用来对冲房贷月供，都不足的情况下就需要从贷款银行指定的还款银行卡账户中进行扣款了。