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水藻一般泛指水生藻类植物，共约为2100属，27000种。

水藻可根据所含色素、细胞构造、生殖方法和生殖器官构造的不同分为绿藻门、裸藻门、轮藻门、金藻门、黄藻门、硅藻门、甲藻门、蓝藻门、褐藻门和红藻门；也可以根据色素的颜色分为绿藻、褐藻和红藻，其中绿藻（如海莴苣和水绵）只有叶绿素，褐藻（如墨角藻属植物）只有褐色和黄色色素，红藻则含有红色和蓝色色素（藻蓝素）。

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